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宏基因组测序数据分析流程-实战

1 宏基因组介绍 2 宏基因组测序数据质控-fastp软件 3 宏基因组测序去除宿主序列 4 宏基因组测序组装 5 宏基因组基因预测 6 非冗余基因集获取 7 基因集丰度 8 宏基因组物种注释 9 宏基因组测序Alpha多样性分析 10 宏基因组测序Beta多样性分析 10.1 PCA 10.2 PCOA 10.3 NMDS 11 LEfSe分析 12 ANOSIM 13 宏基因组测序功能注释 14 宏基因组测序的通路富集分析 15 宏基因组关联研究(MGWAS) 16 群落结构与环境因子的相关性分析
首页 教程 宏基因组测序数据分析流程-实战 群落结构与环境因子的相关性分析
群落结构是指在一定区域内,生物种群之间的数量、种类、分布以及相互关系的总和。这种结构受到多种环境因子的影响,包括但不限于气候条件(如温度、降水、光照等)、土壤特性(如质地、营养状况、pH值等)、地形地貌、水源状况、人为干扰程度等因素。 相关性分析主要探讨这些环境因子如何塑造和影响群落的物种组成、物种多样性、种间竞争与共生关系、优势种及生态位分化等特征。例如,气候变暖可能会改变物种分布区,导致群落结构发生变化;土壤养分含量的高低则可能直接影响植物群落的生长状况和演替过程;地形地貌的不同可以造成微生境的差异,进而影响到动物和植物的分布和生存。 通过统计学方法对群落结构与环境因子进行相关性分析,有助于我们理解生物群落动态变化的内在机制,预测气候变化或人类活动对未来生态系统的影响,并为生态保护和恢复提供科学依据。

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