MLST分型

1 MLST概述 1.1 MLST定义和基本原理 1.2 MLST的发展历程 1.3 MLST在微生物学研究中的应用 2 MLST方法和技术 2.1 MLST基于PCR的方法 2.1.1 PCR引物设计 2.1.2 PCR反应条件优化 2.1.3 PCR产物纯化和测序 2.2 MLST基于新一代测序技术的方法 2.2.1 MLST的测序文库构建 2.2.2 MLST的高通量测序 2.2.3 MLST的数据分析和解读 2.3 其他MLST方法 2.3.1 MLST的多重PCR 2.3.2 MLST的荧光定量PCR 2.3.3 MLST的数字PCR 3 MLST数据库和软件 3.1 MLST数据库介绍 3.1.1 PubMLST 3.1.2 BIGSdb 3.1.3 EnteroBase 3.2 MLST数据分析软件 3.2.1 Geneious 3.2.2 MEGA 3.2.3 BioNumerics 4 MLST结果解读和应用 4.1 MLST分型结果解读 4.1.1 ST（序列型）和CC（克隆复合群）的概念 4.1.2 MLST结果的树状图和网络图的解读 4.2 MLST在疾病监测和防控中的应用 4.2.1 MLST在疾病暴发调查 4.2.2 MLST在病原体传播模式研究 4.2.3 MLST在抗生素耐药性监测 4.3 MLST在生物多样性研究中的应用 4.3.1 MLST在微生物种群结构分析 4.3.2 MLST在物种分化和进化研究 5 MLST实验操作和注意事项 5.1 实验材料准备 5.1.1 MLST实验的样品采集和保存 5.1.2 DNA提取 5.2 实验步骤 5.2.1 PCR扩增 5.2.2 PCR产物纯化 5.2.3 测序 5.3 MLST实验注意事项 5.3.1 实验安全 5.3.2 实验质量控制 5.3.3 实验数据管理 6 MLST未来发展趋势和挑战 6.1 新一代测序技术对MLST的影响 6.2 MLST在精准医疗和个性化治疗中的应用前景 6.3 MLST标准化和数据共享的问题与对策