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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 如何理解KEGG MODULE图
KEGG MODULE是KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库中的一个模块,它将一系列相关的基因和分子功能整合在一起,以描绘出生物体内的特定生化过程或信号通路。每个MODULE都代表了一个生物系统或过程,如糖酵解、氧化磷酸化等。 理解KEGG MODULE图的关键在于理解其组成部分。每个MODULE图由一系列节点(nodes)和边(edges)组成。节点代表了参与该过程的基因、蛋白质或小分子化合物,而边则表示这些节点之间的相互作用或关系。 在MODULE图中,节点通常被标记为不同的颜色和形状,以表示它们的不同类型和功能。例如,圆形节点通常代表酶或蛋白质,方形节点代表小分子化合物,而三角形节点则可能代表信号分子或调节因子。 此外,MODULE图中的边也带有方向性,表示物质或信息的流动方向。例如,箭头从一个节点指向另一个节点,表示第一个节点产生的物质或信号可以影响到第二个节点的功能。 总的来说,通过分析KEGG MODULE图,我们可以更深入地理解生物体内各种复杂的过程和相互作用,从而有助于我们更好地理解和研究生物学问题。

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