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介绍

Salmon不比对快速宏基因组基因定量

输入

1.参考序列索引: 用salmon index对参考序列构建索引的结果路径 2.fq1:左端的read序列文件 3.fq2:右端的read序列文件

结果

生成结果quant.sf,例如 Name Length EffectiveLength TPM NumReads g1 256 36.763 9545.604194 5.000 g2 298 61.085 4595.839603 4.000 g3 299 61.650 5195.523516 4.564
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