介绍
kallisto采用一种被称作伪比对(pseudoalignment)的方式直接将测序片段直接比对到cDNA序列然后定量
在定量之前需要对参考序列构建索引。
输入
fasta文件：
拼接组装后的fasta文件
格式例如
>seqname1
AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTC
>seqname2
GGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGAC
kmer： kmer长度值
结果
索引文件，用于后续定量分析
