linux常用操作(针对生信分析)

1 文件与目录操作 1.1 查看、切换、显示路径 1.1.1 ls 1.1.2 cd 1.1.3 pwd 1.2 创建、删除、复制、移动 1.2.1 mkdir 1.2.2 rm 1.2.3 cp 1.2.4 mv 1.3 按条件查找文件 1.3.1 find 1.3.2 locate 1.4 查看磁盘使用情况 1.4.1 du 1.4.2 df 2 文件内容查看与处理 2.1 查看文件内容 2.1.1 cat 2.1.2 less 2.1.3 head 2.1.4 tail 2.2 wc 统计行数、单词数 2.3 grep 文本搜索匹配 2.4 awk 文本处理与格式化 2.5 sed 流编辑器进行文本替换 3 文件权限与属性 3.1 chmod 修改文件权限 3.2 chown 修改文件所有者 4 进程管理 4.1 ps 查看进程状态 4.2 动态查看进程资源占用 4.2.1 top 4.2.2 htop 4.3 kill 终止进程 5 文本处理高级命令 5.1 sort 排序 5.2 uniq 去重统计 5.3 cut 按列切割文本 5.4 paste 按列合并文件 6 数据操作与流处理 6.1 | 管道符重定向数据流 6.2 >, >> 输出重定向与追加 6.3 < 输入重定向 7 压缩与解压 7.1 gzip/gunzip压缩解压 7.2 bzip2/bunzip2压缩解压 7.3 tar 打包与解包 8 性能监控与系统信息 8.1 free 查看内存使用 8.2 df 查看磁盘空间 8.3 lscpu 查看CPU信息 9 生信分析专用场景(后台运行、下载、文件完整性检验、命令路径) 9.1 nohup, & 后台运行程序 9.2 wget, curl 下载数据 9.2.1 wget 9.2.2 curl 9.3 md5sum 校验文件完整性 9.4 which, type 查看命令路径 9.4.1 which 9.4.2 type